L'hémagglutinine et la neuramidinase sont véritablement les armes du virus.
L'hémagglutinine vient s'accrocher sur les cellules cibles, en particulier les cellules épithéliales de l'arbre respiratoire.
La neuramidinase agit comme une paire de ciseaux : elle détache des cellules cibles les nombreux nouveaux virus qui viennent d'y être fabriqués grâce au mécanisme de la réplication virale. Ces nouveaux virus se disséminent. C'est essentiellement au cours des 48 premières heures de l'infection que cette dissémination a des chances d'être enrayée.